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單細胞多組學測序技術(shù)Parallel-seq的原理是什么?

更新時間:2025-05-08      點擊次數(shù):157
Parallel - seq 巧妙結(jié)合了組合條形碼標記與微液滴測序技術(shù),實現(xiàn) “微液滴過載" 策略,從而能夠高通量、低成本地在同一個單細胞中同步測量基因表達(scRNA - seq)和染色質(zhì)可及性(scATAC - seq)1。其具體原理如下:


  • 組合索引:通過對細胞進行組合條形碼標記,給每個細胞及其內(nèi)的核酸分子加上標簽。這樣在后續(xù)的測序分析中,就可以根據(jù)這些標簽來區(qū)分不同細胞的基因表達和染色質(zhì)可及性信息,實現(xiàn)對大量單細胞的同時分析,大大提高了通量。

  • 微液滴過載技術(shù):將帶有不同標簽的細胞和相應的試劑包裹在微液滴中。通常情況下,一個微液滴中會包含一個細胞以及用于裂解細胞、釋放核酸、進行標記和擴增等反應的試劑。通過這種方式,在微液滴內(nèi)實現(xiàn)對單個細胞的基因表達和染色質(zhì)可及性的同步檢測。“微液滴過載" 策略則是在一個微液滴中同時處理多個細胞,進一步提高了實驗效率,使得一次實驗可并行分析數(shù)十萬乃至百萬級細胞,同時降低了單個細胞的成本1。

  • 測序與數(shù)據(jù)分析:對微液滴中標記和擴增后的核酸進行測序,得到基因表達和染色質(zhì)可及性的數(shù)據(jù)。然后通過生物信息學方法對這些數(shù)據(jù)進行分析,根據(jù)細胞的標簽信息將不同細胞的數(shù)據(jù)分開,并分別對基因表達和染色質(zhì)可及性進行分析,同時還能在單細胞水平上研究兩者之間的相互關(guān)系。



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